黑龙江畜牧兽医

2020, No.605(17) 12-17+165

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NCOA1基因mRNA表达及多态性与黔北麻羊产羔性状关联性分析
Association analysis of mRNA expression and polymorphism of NCOA1 gene with lamb traits in Qianbei ma goats

敖叶;周志楠;吴雨;洪磊;骆金红;张艳;陈祥;

摘要(Abstract):

为了研究核受体辅激活蛋白1(NCOA1)对黔北麻羊繁殖性能的影响,试验采用DNA测序技术,利用SeqMan软件分析测序结果初步筛选SNP位点,根据筛选出的SNP位点应用RNA在线二级结构预测软件中的RNA secondary structure prediction、ProtScale、DNAStar软件中的EditSeq分析NCOA1基因突变位点的二级结构、理化性质、亲疏水性、结构域,运用SPSS 20.0软件分析NCOA1基因型与产羔数的关联性;再应用实时荧光定量PCR方法检测NCOA1基因在黔北麻羊子宫、输卵管、垂体、下丘脑、卵巢5个器官中mRNA的表达水平。结果表明:在外显子7处发现2个SNP位点,命名为G144A和G155A,其中G144A属于同义突变,编码的氨基酸未发生改变,G155A属于错义突变,编码的精氨酸突变为赖氨酸,导致外显子7所编码的氨基酸自由能升高,稳定性降低,分子质量变大,等电点升高,疏水性增强,但未发现保守结构域和特殊结构域,即NCOA1基因外显子7编码的蛋白无特异结构和独立功能;对G155A位点进行基因分型,发现GG基因型个体产羔数分别比GA、AA基因型个体多0.249只(P>0.05)和0.377只(P<0.05);NOCA1基因mRNA在黔北麻羊5个器官中均有表达,在下丘脑中的表达量最高,在输卵管中的表达量最低,且卵巢、下丘脑中的表达量极显著高于输卵管、子宫(P<0.01),垂体中的表达量显著高于子宫和输卵管(P<0.05)。说明NCOA1基因对黔北麻羊繁殖性能有一定影响,有G155A突变位点的GG基因型也对黔北麻羊高产有一定影响,可作为筛选黔北麻羊高繁殖力品系的一个潜在指标。

关键词(KeyWords): 核受体辅激活蛋白1;黔北麻羊;基因分型;实时荧光定量PCR;差异表达;产羔性状

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金项目(31760652);; 贵州省科技重大专项([2016]3002);; 贵州省优秀青年科技人才项目([2017]5624)

作者(Author): 敖叶;周志楠;吴雨;洪磊;骆金红;张艳;陈祥;

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参考文献(References):

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